Συνέλευση Αντιπροσώπων των κλάδων του παραρτήματος
Εκλέγεται για τριετή θητεία, χωριστά για κάθε κλάδο με άμεση εκλογή.
Η Διοικούσα Επιτροπή του Παραρτήματος
Η Διοικούσα Επιτροπή είναι το όργανο Διοίκησης του Παραρτήματος, έχει 11 μέλη, αναδεικνύεται με καθολικές εκλογές και έχει τριετή θητεία. Σε αυτή συμμετέχουν 4 γεωπόνοι, 2 δασολόγοι, 2 κτηνίατροι, 2 γεωλόγοι και 1 ιχθυολόγος Επισημαίνεται ότι σε κάθε παράρτημα λειτουργούν και οι πενταμελείς επιτροπές κλάδων (μία για κάθε κλάδο). Κάθε επιτροπή εκλέγεται ανά τριετία από τον αντίστοιχο κλάδο της Συνέλευσης των αντιπροσώπων κάθε παραρτήματος με το σύστημα της απλής αναλογικής.
Αναλυτικά τα όργανα των περιφερειακών παραρτημάτων του ΓΕΩΤ.Ε.Ε. αναφέρονται ανά παράρτημα όπως παρακάτω:
Παράρτημα Ανατολικής Στερεάς Ελλάδας, με έδρα την Αθήνα
Παράρτημα Κεντρικής Μακεδονίας, με έδρα τη Θεσσαλονίκη
Παράρτημα Κεντρικής Ελλάδας, με έδρα τη Λάρισα
Παράρτημα Πελοποννήσου & Δυτικής Στερεάς Ελλάδας, με έδρα την Πάτρα
Παράρτημα Ανατολικής Μακεδονίας, με έδρα την Καβάλα
Παράρτημα Ηπείρου & Νήσων, με έδρα τα Ιωάννινα
Παράρτημα Κρήτης, με έδρα το Ηράκλειο
Παράρτημα Θράκης, με έδρα την Αλεξανδρούπολη
Παράρτημα Δυτικής Μακεδονίας, με έδρα την Κοζάνη
Παράρτημα Αιγαίου, με έδρα τη Σύρο (η έδρα του παραρτήματος βρίσκεται προς το παρόν στη Μυτιλήνη)