Σημαντικά θέματα που παρουσιάστηκαν, επηρεάζουν την εύρυθμη λειτουργία του Μέτρου και καθιστούν ιδιαίτερα δυσχερή την έγκαιρη υποβολή των τελικών αιτήσεων πληρωμής των επενδυτών αγροτών στο ηλεκτρονικό σύστημα του Πληροφοριακού Κρατικού Συστήματος Ενισχύσεων (ΠΣΚΕ), κάτι που επιβάλλει τη χορήγηση παρα΄τασης στην προθεσμία υλοποίησης του Μέτρου.