Η λειτουργία του ΟΠΕΚΕΠΕ εντός της ΑΑΔΕ θα διασφαλίσει, αφενός μεν υψηλό επίπεδο ελέγχου - μιας και η εμπειρία της ΑΑΔΕ, ειδικά σε αυτό το κομμάτι, είναι αποδεδειγμένη εδώ και πολλά χρόνια. Ταυτόχρονα, όμως, θα δημιουργήσει τη δυνατότητα της διανομής των ευρωπαϊκών πόρων με πλήρη και απόλυτη διαφάνεια και δικαιοσύνη.