Το Τμήμα Επιστημών της Θάλασσας του Πανεπιστημίου Αιγαίου σε συνεργασία με τα Τμήματα Περιβάλλοντος και Γεωγραφίας του Πανεπιστημίου Αιγαίου καθώς και το Ελληνικό Κέντρο Θαλασσίων Ερευνών (ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε.) οργάνωσε και λειτουργεί Διατμηματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) στο αντικείμενο «ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗ ΠΑΡΑΚΤΙΩΝ ΠΕΡΙΟΧΩΝ» και απονέμει Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης στη «Διαχείριση Παρακτίων Περιοχών». Η χρονική διάρκεια των σπουδών για την απονομή τίτλου για το Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης ορίζεται σε δύο (2) εξάμηνα. Η παρακολούθηση των μαθημάτων είναι υποχρεωτική.